办公室（党委办公室）。承担机关文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、督查督办等工作;承办党委文件、会议、督办等有关日常综合性事务。

法制科。承担依法行政工作；承担涉及多个税种、社会保险费和有关非税收入综合性政策文件的办理；负责规范性文件管理工作；承担重大执法决定案件审理；承担行政复议及行政诉讼工作；承担涉税反补贴案件应对工作；承担公职律师和法律顾问相关工作。

税政科。负责组织实施各税种政策落实工作；组织落实各项税收优惠政策；负责组织实施增值税专用发票、普通发票和其他抵扣凭证管理；指导各税种的日常管理、日常检查；参与各税种的风险管理、纳税辅导、咨询服务等工作。

社会保险费和非税收入科。负责组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费征收管理工作；负责组织实施文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入的征收管理工作。

收入核算和税收经济分析科。组织实施本辖区税收、社会保险费和有关非税收入的中长期规划；拟订出口退（免）税年度安排，组织实施免抵调库年度安排；负责统筹协调本辖区免抵调库、税收收入的预测分析和重点税源监控管理工作。

纳税服务科。负责贯彻落实服务规范及办税规程;依纳税人申请办理涉税基础事项;组织实施基础信息维护、基础数据应用等管理;办理依纳税人申请的非即办型非审批类涉税基础事项;组织实施基础信息维护、基础数据应用等日常管理。

征收管理科。组织实施税收征管法律法规、规章及规范性文件；组织实施户籍管理等征管工作；组织实施日常征管工作；组织实施信息化建设工作。

国际税收管理科。负责辖区内非居民境内所得和居民境外所得等跨境税源的税收管理；负责辖区内“一带一路”“走出去”企业和个人的税收服务；负责本单位外事管理工作。

税收风险管理局。负责统筹开展风险管理及风险事项内控工作；承接风险管理部门的专项工作任务；负责对接稽查系列工作。

财务管理科。组织实施预决算管理、基建、会计核算管理、财务内控管理和政府采购、资产管理等工作；承担机关财务管理工作。

组织人事科。组织实施干部人事制度及人才队伍建设；承担人事、机构编制、干部考核、劳动工资等工作；负责教育培训工作。

考核考评科。负责贯彻落实绩效管理和数字人事工作；组织实施绩效考评等工作。

税源管理一科。负责辖区纳税人税务行政审批事项和其他依纳税人申请涉税事项集中审核办理。

税源管理二科。负责辖区房地产、建筑安装企业以及行政事业单位的日常管理、风险应对和个性化服务；负责房地产项目土地增值税项目登记、预缴、清算全链条管理；负责企业和个人存量房交易涉税业务办理;负责不动产登记中心和私房出租委托代征工作；负责管辖范围内反避税、非居民跨境税源等国际税收日常管理工作。

税源管理三科。负责辖区除税源管理二科、第二税务所所辖企业以外的高新技术企业和高新街道北环大道以南辖区企业的日常管理、风险应对和个性化服务；负责管辖范围内反避税、非居民跨境税源等国际税收日常管理工作。

机关党委（党建工作科）。组织实施党建和党风廉政建设工作；统筹负责机关党群思想政治建设、意识形态建设、税务文化建设、精神文明建设和统战工作；协调机关工会、共青团、妇委会开展群团工作；负责承接上级巡察工作任务。

老干部科。负责老干部工作。

根据有关规定，设置党委纪检组，负责党的纪律检查工作。